其次，是規模的急劇擴張。原格物院蝸居在將作監一角，不過數十間屋舍。李瑾劃撥巨額經費，在洛陽城南、洛水之濱，擇地百頃，興建龐大的新院區。新院區規劃宏大，分為多個區域：百工坊（各類工匠實驗、制作場所）、藏書閣與繪圖樓（收藏典籍、圖紙、海圖、地理資料）、算學館與觀星臺（數學、天文研究）、博物苑（搜集奇珍異獸、礦石、植物標本）、醫道館（醫藥、解剖研究）、講學堂與生員宿舍。其規模建制，幾乎相當于一所小型的綜合性大學。
再次，也是最具突破性的，是人才招募方式的變革。李瑾深知，傳統的科舉取士和門蔭制度，難以選拔出他所需的實用人才。他親自擬定并報請批準了全新的《格物院征辟條例》：
1.廣開才路，不分士庶：明確宣告，凡通曉一技之長，無論出身士農工商，甚至僧道、蕃客，只要身家清白，有一技之長，皆可自薦或由人保薦，經考核后入院。優秀者，不僅給予豐厚薪俸，還可授予“待詔”、“直院”、“博士”等官職銜，享有相應的政治待遇和社會地位。此舉打破了“工之子恒為工”的階層壁壘，也向天下傳遞了“技藝亦可通顯”的強烈信號。
2.分科考核，注重實績：考核不再以經義文章為主，而是分門別類。欲入“百工坊”者，需現場演示技藝，或呈交發明模型、圖紙；欲入“算學館”者，需解答難題，演示算法；欲入“醫道館”者，需有行醫經驗或獨特驗方；欲入“航海科”者，需熟悉海情、能辨識星象……一切以實際能力為準。
3.高薪厚祿，吸引頂尖人才：格物院各級職事的薪俸，遠高于同級朝廷官員。對能解決重大技術難題、有重要發明創造者，更有重金賞賜，甚至可能賜爵。李瑾深知，沒有實實在在的利益，難以吸引真正的人才投身于這被士林輕視的“匠作”之中。
4.設立“生員”制度，培養后備力量：面向全國招收十五至二十歲的聰慧少年，不拘出身，通過基礎算學、識字考核后，可入院為“生員”，享受食宿補貼，系統學習算學、格物基礎、制圖、文書等，并根據興趣分科深入，由院內“博士”、“直院”授課。優秀生員可留院任職，或推薦至工部、將作監、水師等處。這實際上是在建立一套獨立于國子監、官學體系之外的、注重實用技術的教育系統。
詔令一出，天下嘩然。洛陽、長安的士林清議之中，譏諷者有之――“朝廷竟以重金求奇技淫巧，與市井匠人為伍，成何體統？”“李瑾恃功而驕，蠱惑圣聽，壞我朝取士之道！”憂慮者有之――“長此以往，誰還愿寒窗苦讀圣賢書？”但同樣，也有無數被傳統仕途排斥、身懷絕技卻郁郁不得志的能工巧匠、民間學者、落魄方士、甚至遠道而來的異域技師，心中燃起了希望。
接下來的幾個月，洛陽城南的格物院新址，成了帝國最忙碌、也最引人矚目的地方。建筑工地上，工匠民夫日夜趕工，一座座功能各異的館舍拔地而起。而在臨時設立的招募處前，更是排起了長龍。前來應募的人五花八門：
有來自河北、能將弩機射程提高三成的老軍器匠；有來自江南、擅長建造大型樓船和水車的老船工；有來自蜀中、精通地質堪輿的隱士；有來自嶺南、熟悉海外香藥的海商后人；有來自西域、通曉天文歷算的粟特裔學者；甚至還有幾位自稱來自“大秦”（拂h，即東羅馬）的景教僧侶，攜帶著一些奇怪的機械圖和數學手稿前來碰運氣……
考核的過程嚴格而務實。在“百工坊”考核區，斧鑿錘鋸之聲不絕，火光四濺，應試者當場打造零件、組裝機括。在“算學館”，應試者需在沙盤或紙上快速演算復雜的開方、方程和面積體積問題。在“醫道館”，則有經驗豐富的老軍醫坐鎮，考核辨識藥材、處理外傷甚至探討一些理論問題……
李瑾時常親臨考核現場。他看到一位來自明州（寧波）的老漁民，僅憑一根繩結和觀察水色，就能準確判斷海流和魚群，被破格錄入新設的“航海科”。他看到一位關中鐵匠，展示了一種能極大提高鐵水純度的“炒鋼法”改良工藝，當場被聘為“直院”。他還看到一位年輕的書生，雖不通經義，卻對《九章算術》和勾股測量有著驚人天賦，被算學館的博士如獲至寶。
當然，招募過程中也非一帆風順。有士子前來搗亂，嘲諷應募的工匠“沐猴而冠”；也有江湖騙子企圖以拙劣的“法術”蒙混過關，被當場拆穿趕出。但總體上，一套新的人才選拔和集聚機制，正在磕磕絆絆中建立起來。
至麟德九年夏末，格物院新院區主體建筑陸續竣工。院內匯聚了來自全國各地、乃至域外的各類人才已超過五百人，其中“博士”、“直院”等高級研究人員近百人，“生員”首批招收了兩百人。院內初步劃分了“軍器所”、“舟車所”、“礦冶所”、“天文算學所”、“農水利所”、“醫道所”、“博物所”、“海疆所”等八大研究部門，每個部門下又細分若干課題組。
李瑾為格物院確立了明確的研究方向：軍器改良（重點是火炮輕型化、精度提高、火藥配方優化、火槍雛形探索）、船舶設計與航海技術（研制更大更快的遠洋帆船、改進帆索系統、研制更精確的航海羅盤和計時器、繪制全球海圖）、礦冶與材料（改進金銀銅鐵冶煉技術、探索新合金、開發倭國及其他地區的礦藏）、農業與水利（培育高產作物、改進農具、興修水利模型）、基礎科學（數學、天文、物理、化學的初步系統化研究，包括李瑾“提點”的幾何光學、力學原理、元素猜想等）、醫藥衛生（整理驗方、研究解剖、防治航海疾病如壞血病）、地理與博物（搜集整理天下物產、地理、民俗資料，為擴張和貿易服務）。
格物院的大門上，懸掛著李瑾親筆題寫的匾額：“格物致知，經世致用”。這八個字，成了這座新興學術殿堂的最高宗旨。院內，不再是埋頭故紙堆的尋章摘句，而是充滿了計算、爭論、實驗、制作的火熱場景。算盤的噼啪聲、繪圖時的沙沙聲、鍛打鐵器的叮當聲、爭論問題的激昂話語聲，交織成一首不同于太學、國子監瑯瑯書聲的、卻充滿蓬勃生機的“新學”交響曲。
朝中的非議并未停止，但看著格物院那日益龐大的規模、皇帝天后堅定不移的支持、以及李瑾那不容置疑的權威，反對的聲音暫時被壓了下去。許多人都在觀望，這個耗費了巨額倭國金銀、聚集了眾多“奇人異士”的格物院，究竟能結出怎樣的果實。
李瑾站在剛剛落成的觀星臺頂層，俯瞰著腳下初具規模的格物院建筑群，又望向遠方天際。他知道，種子已經播下，土壤已經施肥。接下來，就是耐心等待，并小心呵護這些可能改變整個文明進程的幼苗。科學的種子，已然在盛唐的土壤中，破土而出。而它的未來，或將比征服十個倭國，更加深遠地影響這個世界的走向。_c